Secondo me, quello che si vede è l’incipit/prologo della storia (magari, per scelte di trama, raccontato a metà gioco come un flashback per dare al giocatore gli ultimi tasselli del perché Ellie e Joel stanno cacciando altri esseri umani).
Quelli che si vedono giacere in terra sono effettivamente i cadaveri di alcuni membri delle Luci.
Ma.
NON sono stati uccisi da Ellie/Joel, sono stati uccisi da un gruppo differente (o da una frangia estremista delle Luci stesse, va bene uguale (anzi, forse forse, alla luce di come finisce Parte I, è anche meglio)) il cui unico scopo è di trovare un vaccino al virus zombificante. A QUALSIASI costo. E con QUALSIASI mezzo.
Per perseguire questo loro scopo sono determinati a ricercare, catturare e dissezionare (volente o nolente) qualsiasi essere umano vivente che possa anche solo mostrare segni di una minima resistenza/tolleranza al virus.
In questa loro ricerca son venuti a conoscenza del precedente di Ellie, di come fosse ritenuta un eccellente (l'unico? (in Parte I non viene mai chiarito se ce ne fossero altri/altre come Ellie)) fonte per il vaccino e di come fosse misteriosamente scomparsa.
Dopo una ricerca durata anni, questo gruppo riesce a rintracciare un sopravvissuto (uno dei dottori che stava per operare Ellie, magari) che ha trovato rifugio in un gruppo di Luci (che, magari, ha stabilito contatti amichevoli colla comunità dove Joel ed Ellie si sono rifugiati). In un tentativo di estorcere l'informazione al dottore (riottoso a rivelarla, in quanto ha avuto crisi postume di coscienza che lo hanno portato a rivalutare negativamente l'operato del gruppo di Luci di Parte I), membri di questo nuovo gruppo assaltano il villaggio e massacrano le persone che vi vivevano nel tentativo di estorcere (invano) l'informazione al dottore. Ellie e Joel, per pura combinazione, si recano in visita di cortesia al villaggio, arrivano a cose accadute e sorprendono solo gli ultimi membri del gruppo, rimasti indietro coll'ordine di ricercare qualsiasi informazione utile sulla posizione di questo "paziente zero" (Ellie) e di ripulire qualsiasi traccia possa ricondurre a questo misterioso gruppo.
Visto il massacro perpetrato, Ellie e Joel (soprattutto Joel) si mettono a cacciare questi membri, uccidendoli uno ad uno. Ellie, entrata in una casa per verificare se vi sono dei nemici sopravvissuti nascosti, si imbatte nei cadaveri che si vedono nel video e, mentre esplora la casa, vede una chitarra sul letto: sopraffatta dalle emozioni, si siede sul letto ed intona la canzone del video. Joel, al termine della sua caccia, sente la canzone di Ellie (che fa si che Jole si plachi dalla sua “frenesia del cacciatore”)e, seguendone il suono, entra nella casa dimentico di avere ancora la pistola in mano (o, forse, il suo istinto di sopravvivenza gli impedisce di riporla), entra nella stanza dove si trova Ellie e parte il dialogo di vendetta di Ellie.
Una cosa messa così si abbinerebbe bene anche al tema portante del gioco, la vendetta.
Ed il THEM del dialogo, IMHO, significa che Ellie, per quello che hanno fatto agli abitanti del villaggio, non li ritiene più degni di essere considerati (e trattati da) umani.