In due settimane ce la fate a fare tutto tranquillamente, secondo me, considerando anche gli spostamenti e senza affanno.
Considerando però proprio gli spostamenti, Siena è mal collegata con il treno (mio fratello ci ha fatto l'Università), magari vedi se esiste un servizio di autobus che vi porta direttamente lì.
In una giornata (anche mezza, in verità) Siena la visiti, è veramente minuscola. Attento a non beccare le giornate del palio per i costi.
Firenze direi un paio di notti, tre al massimo, se volete girarvi anche gli Uffizi (ma vedi se è possibile prenotare il biglietto, sennò passi la giornata in coda).
Venezia e Napoli idem come Firenze.
I paesi della costiera, Amalfi, Sorrento, Ravello, Minori, sono piccoli: ti ci fai una breve passeggiata e li hai visti, quindi puoi pensare di andare e tornare in giornata o magari arrivare ad Amalfi da Napoli, girarla e fare tappa a Sorrento prima di rientrare a Napoli. Anche perché un hotel in costiera credo sia molto più caro di uno a Napoli.
A quel punto hai anche Capri e Ischia, anche quelle da visitare in giornata per evitare di donare un rene ai napoletani.
Napoli invece è enorme, dovresti capire cosa vorresti vedere. Un giro alla Napoli sotterranea però me lo farei:
https://www.napolisotterranea.org/A questo punto salterei Siena, che vi fa perdere tempo per raggiungerla e c'è relativamente poco da vedere.
Ma nei 15 giorni c'è anche la visita di Roma?