Direi che è così anche per Twitter.
Il punto è che hashtag e impostazioni privacy sono concetti diversi. L'hashtag influenza l'indicizzazione degli argomenti, la privacy cambia la visibilità del tuo profilo. Il secondo annulla qualche beneficio portato dal primo, nel caso del profilo privato.
Ma per esempio potresti avere un profilo privato con un milione di follower per cui mettere un # sarebbe utile.
Potresti anche decidere di non rendere più privato il tuo profilo in un secondo tempo, per cui ancora l'# avrebbe di nuovo senso.