Dico io: con Linux installo l'SO e mi fa scegliere se avere KDE o Gnome; perchè Android che è suo cugino no?
Si, piu' o meno, i launcher ci sono ma non vanno a modificare tutte quelle root app volute e create dal produttore di turno (rubrica, telefono, messaggi e via andare), ma anche su Linux fai delle scelte come il sistema di pacchettizzazione che vuoi usare e in base a quello la distribuzione che ha comunque (seppur in maniera meno invasiva) le sue personalizzazioni e le sue differenze che sono pero' meno evidenti (versioni di librerie, kernel, moduli del kernel) all'utilizzatore finale
superficiale che ultimamente arriva su Linux grazie anche al lavoro di Canonical.
Se l'interfaccia grafica si limitasse al launcher sarei d'accordo pure io, purtroppo in molti casi la personalizzazione e' piu' profonda come ben sai e chiedere un vanilla insieme a quello personalizzato diventerebbe oneroso in termini di spazio, non la vedo fattibile. La vera svolta ci sara', se ci sara', con la commercializzazione della nuova gamma Nexus che potrebbe andare a coprire diversi segmenti di mercato dando l'opportunita' di scegliere anche la diagonale del dispositivo se uno e' alla ricerca del "pure Google experience*" dal piccolo economico tascabile al top gamma con lo schermo da 600 pollici, passando pure per i tablet.
*eppero' pure Google deve smettere di fare le cazzate eh, come i modelli diversi di Galaxy Nexus che hanno un rilascio degli aggiornamenti diverso.