Premetto che uso un MAC, comunque l'utilizzo delle font nei due programmi dovrebbe essere identico.
Secondo me 4300 font sono un pelino tante. Tieni a disposizione nella cartella font (non so come si chiami e dove sia in un PC) solo quelle principali Arial, Times ecc.ecc più quelle che ti interessano per il progetto che stai seguendo. Le altre mettile in una cartella archivio e scambiale all'occorrenza.
Esistono anche dei programmi specifici che consentono di gestire le font rendendole disponibili all'occorrenza, purtroppo ora mi sfuggono i nomi, se ti servono vado a cercarli.