Non preoccuparti, credo che sia normale che ti visualizzi l'espansione più recente all'avvio ma poi comunque ti farebbe passare per il gioco base inizialmente quando crei un nuovo personaggio.
Le espansioni si avviano dopo aver completato una (lunga) serie di quest in sequenza, tipo io per arrivare a poter anche solo iniziare Heavensward ho dovuto prima completare il gioco base con tanto di credits e poi fare tutta una serie di quest postgame correlate, il gioco ti avviserà quando ci sarà da fare anche qualche quest particolare fuori dalla main, lo dico perchè ce ne sono molte di opzionali ma che in genere sbloccano ricompense uniche, io le ho fatte tutte (opzionali o meno).
In alternativa dovrebbero anche esserci degli item boost per ypasssare quest e mettersi automaticamente in pari coi livelli richiesti per le espansioni ma non ho mai indagato, proprio perchè io ero e sono molto interessato a trama e narrativa del gioco e quindi non ho saltato nulla così da seguire tutti i dialoghi e non perdere alcun dettaglio di trama
Tra base e espansioni è tutto ereditato e collegato/integrato quindi nessun problema, tieni solo conto che alcuni jobs sono esclusivi di certe espansioni (ad esempio il Samurai credo sia legato alla seconda espansione) ma da questo punto di vista hai massima flessibilità perchè puoi cambiare classe/job in qualsiasi momento tramite la comoda funzione di cambio set nella schermata di equip, consiglio infatti di salvarsi nel log i vari set utilizzati più di frequente.
In sostanza puoi ipoteticamente iniziare la partita con un healer ma poi in futuro passare a guerriero, mago nero, rogue, paladino e così via senza limiti a patto di avere armi ed equip giusti e di aver fatto le rispettive quest di sblocco classe/job specifiche!