Nella versione che sto usando io (1.1.34), la cartella si chiama My Dropbox.
In sostanza, su Win l'ho spostata dalla cartella di default a una cartella tipo e:\roba condivisa\My Dropbox.
Ora, se da Linux provo a spostare la cartella in \roba condivisa, mi crea là dentro una nuova cartella Dropbox, e quindi mi ritrovo due cartelle affiancate e duplicate. Se gli dico di usare My dropbox come cartella, mi crea lì dentro una nuova cartella Dropbox, e il problema si ripropone.