Il gioco è diviso in due parti centrali, con un prologo introduttivo e una conclusione: nel prologo, Joel viene picchiato e infine giustiziato da un gruppo di sconosciuti tra i cui membri di spicco c’è Abby, una bionda nerboruta che è anche l’esecutrice materiale dell’uccisione di Joel. Tutto questo avviene sotto gli occhi disperati di Ellie, la quale si mette in viaggio per cercare gli assassini di Joel e vendicarlo. Ad accompagnarla ci sono Dina, che ama e da cui è ricambiata, Jesse, ex-fidanzato di Dina e Tommy, il fratello di Joel. Durante questa fase si scopre che Dina è incinta di Jesse. La caccia si conclude con uno scontro frontale in cui Abby arriva a puntare la pistola contro Ellie. Sta per premere il grilletto quando l’azione viene interrotta per passare alla seconda parte.
Qui impersoniamo Abby principalmente in tre diverse fasi della sua vita: nel suo passato facciamo la conoscenza dei suoi amici (e futuri carnefici di Joel) e scopriamo che
suo padre era il chirurgo che stava eseguendo l’operazione sul corpo di Ellie per ricavare la cura per il virus, prima che Joel lo accoltellasse per salvarle la vita
. Viviamo con lei i giorni precedenti alla caccia di Joel e quelli successivi in cui vediamo i suoi amici (nel frattempo divenuti anche nostri) cadere uno ad uno per mano di Ellie. Proprio in quei giorni con lei stringeremo un rapporto materno nei confronti di due ragazzini, Yara e in particolare suo fratello minore Lev. Nei confronti di quest’ultimo, infatti, va maturando un rapporto simile a quello che Joel aveva sviluppato con Ellie nel prequel.
Si dipana così un intreccio che ci porta gradualmente al momento interrotto in precedenza, quando finalmente vediamo che
Ellie riesce miracolosamente a sottrarsi al tiro di Abby. Abby in quel momento è il giocatore che ne ha fatto proprie le sofferenze patite per mano di Joel e Ellie. La muoviamo mentre prova ad uccidere quest’ultima. Ne scaturisce una colluttazione feroce che vede infine Abby risparmiare la vita a Ellie e Dina, con la raccomandazione di starle lontana.
Taccio sulla parte finale.