No non solo H264 ma anche MPEG4.
Divx pur essendo una variante non è supportato nativamente.
In altre parole i film o li converti o li scarichi già compatibili.
GameTrailers e compagnia in versione flash non vanno, però molti siti (es. Vimeo) stanno facendo delle versioni compatibili che non usano flash ma html5.
Se iOS continua ad andare così forte, prima o poi lo faranno tutti, anche gametrailers.
Considera però che molte cose che ci sono su GT o altri alla fine si trovano anche su youtube, e quello funziona benissimo con iPad.
I giochini in flash ovviamente non vanno, però mi sembra l'ultimo dei problemi considerando l'app store.