Jetsgo
BMIBaby
Deutsche-BA
Jet2
Hapag-Lloyd Express
Jetblue
MyTravel Lite
Sky Europe
Southwest
Sterling
Norwegian
Snowflake
Air Southwest
Intersky
Evolavia
Kulula
British European
V Bird
Nature Air
Britannia Ticket
Austrian
Snalskjuten
Aer Arann
Air 2000
ecc. ecc.
Per le destinazioni europee un buon motore di ricerca (non racchiude tutte le compagnie, per ovvie ragioni, ma permette di avere un'idea di orari e costi) può essere questo:
http://flights2.infosys.de/indexnf.phtml/ssr30212nofPedro, Delta, che io sappia, non è low cost (il servizio fa cagare, quello sì, ma non credo si possa definire una lc come Southwest).
Per il Giappone di solito Lufthansa ha prezzi abbastanza aggressivi. Direi che per un Milano-Tokyo si sta sempre sui 600 più tasse: non sarà ultragiga-low cost, ma considerando che Milano-Roma (meno di un'ora) a/r va dai 110 (più tasse) in su, non è male.